परमेश्वर ने मानवजाति को तुच्छ दृष्टि से देखा और हर जगह दुष्टता, हिंसा और बुराई देखी। उसने नूह को छोड़कर पृथ्वी पर सभी जीवित चीजों को नष्ट करने का फैसला किया, जिसने ‘प्रभु की दृष्टि में अनुग्रह पाया’ था।
परमेश्वर ने नूह को एक जहाज बनाने का निर्देश दिया जो 300 हाथ लंबा, 50 हाथ चौड़ा और 30 हाथ ऊंचा था। इस संदर्भ में इस बात पर विवाद रहा है कि एक ‘हाथ’ वास्तव में कितना लंबा है: हालांकि एक सामान्य हाथ 18 इंच (एक आदमी के अग्रबाहु की कोहनी से उंगलियों तक की लंबाई) बताया गया था, यह तर्क दिया गया है कि ‘पवित्र’ हाथ कई इंच लंबे थे।
तब भगवान ने नूह को ‘प्रत्येक प्रकार के दो’ जानवरों को जहाज में ले जाने का निर्देश दिया ताकि अन्य जानवरों का सफाया हो जाए, प्रत्येक प्रजाति को इन दो नमूनों के माध्यम से संरक्षित किया जा रहा था। जब नूह 600 वर्ष का था, तब परमेश्वर ने चालीस दिन और रात तक वर्षा कराई, जिससे बाढ़ आई। नूह और उसकी पत्नी, बेटे और उनकी पत्नियाँ, साथ ही वे जानवर जिन्हें वह जहाज़ पर ले गया था, बाढ़ से बच गए।
परन्तु जहाज़ के बाहर की सभी जीवित वस्तुएँ बाढ़ के पानी में नष्ट हो गईं। जहाज अंततः ‘अरारत पर्वत’ पर रुका, न कि माउंट अरारत पर, जैसा कि अक्सर माना जाता है, क्योंकि वहां ऐसा कोई पर्वत नहीं था।
जब पानी कम हो गया, तो नूह ने सूखी भूमि की खोज के लिए जहाज से एक कौवे को भेजा, और फिर एक कबूतर लौट आया, इसलिए नूह ने एक सप्ताह तक इंतजार किया और फिर उसे बाहर भेज दिया। ऐसा कई बार हुआ, इससे पहले कि कबूतर अंततः अपने मुँह में जैतून की शाखा लेकर लौटा: तब से यह शांति का प्रतीक रहा है। 9:13 में परमेश्वर ने नूह को वह इंद्रधनुष दिखाया जो उसने बादलों में स्थापित किया था, जिसके बारे में उसने बताया कि नूह मनुष्य के साथ उसकी वाचा थी, कि वह फिर कभी पृथ्वी पर बाढ़ नहीं लाएगा।
नूह और बाढ़ की कहानी – Story of noah and the flood